Η Μ. Γιαννάκου αντιμετώπιζε προβλήματα με την υγεία της, ενώ τελευταία νοσηλεύονταν σε νοσοκομείο μετά από πτώση που είχε από το αναπηρικό αμαξίδιο.
Διετέλεσε υπουργός Εθνικής Παιδείας και Θρησκευμάτων για την περίοδο 2004-2007 και το όνομά της συνδέθηκε με μία εκτεταμένη απόπειρα μεταρρύθμισης του ελληνικού εκπαιδευτικού συστήματος. Το 2007 αποτυγχάνει να εκλεγεί βουλευτής.
Το 2006 εξήγγειλε νέο νόμο πλαίσιο για τα ΑΕΙ το οποίο στηρίχθηκε σε προτάσεις της αποκαλούμενης από τους δημοσιογράφους «επιτροπής σοφών».
Η μεταρρύθμιση της Μ. Γιαννάκου αναφέρονταν στα συγγράμματα, στο ακαδημαϊκό άσυλο, στους ¨αιώνιους¨φοιτητές, στις Πρυτανικές εκλογές κλπ.
Επίσης η Μ. Γιαννάκου ως υπουργός Παιδείας…
